档案方面有区别

定向研究生其档案、人事、户口、工资关系仍留在原工作单位，毕业后无派遣证及报到证。而非定向的在入学前需要转入到院校，不能按期转入档案的学员将会取消入学资格，毕业后有派遣证及报到证。

培养费用有区别

定向研究生培养费用由定向单位承担，而非定向学员进修主要是为了提升自己的能力，其培养费用由报考人员自己承担，非定向生培养费一些部分也由中央或地方财政拨款。

奖学金有区别

定向研究生一般在校就读期间不能享受奖学金、助学金等，而非定向的学员在校期间能享受国家规定的奖学金和其他生活待遇。

就业有区别

定向研究生在入学前就确定了工作单位，要签定定向协议才能入学，毕业后回原单位。非定向的人员在录取时不确定未来的工作单位，毕业时应服从国家就业指导，在国家规定的服务范围内进行安排或实行双向选择。